PCR (Polymerase Chain Reaction - Polimeraz Zincir Reaksiyonu) tekniği 1990'lı yıllardan sonra giderek yaygınlaşan ve özellikle laboratuvar ortamlarında üretimi güç olan hatta üretilemeyen mikroorganizmaları saptayabilme yeteneği ile mikrobiyolojide devrim yaratan nitelikte bir buluştur.
HIV PCR metodu ile virüsün genetik materyali olan RNA'nın çoğaltılarak, ölçülecek ve tanımlanabilecek duruma gelmesi sağlanır. HIV PCR metodu duyarlı ve özgül bir metoddur ve direkt olarak HIV'in RNA'sını saptar. Az sayıdaki RNA'yı çoğaltıp saptayabildiği için erken evrede HIV virüsünün kanda tespitinde kullanılmaktadır. Enfekte olmuş bir kişinin kanında virüs bulunmasına rağmen erken dönemde virüse karşı antikor oluşmamakta veya oluşan antikor saptanamamaktadır. PCR testi özellikle erken aşamada HIV virüs tespitinde kullanılmaktadır.PCR ile şüpheli temastan 9-11 gün sonra HIV PCR testi ile virüs varlığı saptanabilmektedir. 28. günden itibaren PCR testinin virüsü saptama duyarlılığı ~